Genética populacional do bagre amazônico Pseudoplatystoma punctifer (Siluriformes: Pimelodidae) nas sub-bacias dos rios Madeira e Mamoré/Guaporé
| Primeiro coorientador dc.contributor.advisor-co1 | Batista, Jacqueline da Silva | |
| Currículo Lattes do primeiro coorientador dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9560715515896160 | por |
| Primeiro orientador dc.contributor.advisor1 | Farias, Izeni Pires | |
| Currículo Lattes do primeiro orientador dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/7673734418642222 | por |
| Autor dc.creator | Machado, Antonio Saulo Cunha | |
| Currículo Lattes do autor dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/2314257448794389 | por |
| Data de defesa/publicação dc.date.issued | 2013-12-06 | |
| Resumo / Abstract dc.description.abstract | The great catfish Pseudoplatystoma punchier (surubim) is among the five species of catfish of the Amazon basin with greater commercial value. It plays important role as top predator in freshwater ecosystems of the Amazon. The movement of aquatic species, in watersheds, can be interrupted by natural biogeographic barriers, formed by rapids and waterfalls that produce distinct biota.There are clear differences between the biota (assemblies) of fish in the area that is upstream and downstream of the falls of the Madeira Rive. The waterfalls of Madeira River delimit two distinct regions: upstream the sub-basins of the Mamore/Guapore (which will be called the Mamore/Guapore sub-basin) and downstream the sub-basin of the Madeira River.The knowledge of how the life cycle of P. punchier is influenced by the Madeira River rapids and waterfall, taking into account their migratory route and how much genetic variation occurs in this species, within and between sub-basins, is very important for the conservation and for possible management measures. Molecular analyzes were performed by sequencing the COI gene of mtDNA and 10 microsatellite loci. Our objective was to determine whether P. punchier constitutes a parunitic population or if there is some kind of genetic segregation, associated with space and time, which can be related to the waterfalls of the river Madeira or the homing behavior. Were analyzed 96 specimens with the COI gene and 99 with microsatellite loci from six localities, being two in the the Mamore/Guapore sub-basin and four in the sub-basin of the Madeira River, both in the Amazon basin. With the COI marker were observed 11 haplotypes, a haplotype diversity of 0.600 and a nucleotide diversity of 0.00157. All analyzed microsatellite loci were highly polymorphic, the number of alleles per locus ranging from two (Ppu8) to 22 (Ppu4), on average 10.4 alleles per locus. The total number of observed alleles was 104, with 27 unique alleles. Based on the results of the analysis of molecular variance (AMOVA) and gene flow (Nm) observed between the sub-basins to the microsatellite (PST = 0.067; Nm= 6.883) and for the gene COI ((DST = 0.391; Able 0.643), we cannot reject the hypothesis of panmixia for Pseudoplatystoma punchier. However, it was evidenced that the specimens of P. punchier of Madeira River and Mamore/Guapore sub-basins feature a large genetic differentiation and intermediate for the gene COI and microsatellites, respectively. Genetic differentiation observed in Bayesian analysis of BAPS, with the COI data clearly showed the existence of two maternal lines, an in each sub-basin. This result may be related to: sedentary females; the different environmental conditions; the water regime of the Madeira River and Mamore/Guapoth sub-basins and with rapids and waterfalls and of the Madeira River, which partially disrupt the gene flow. We propose a model of migration of males on the basis of the results of the analysis of microsatellite loci and prior studies of ecology. Our results indicated the occurrence of two fishing stocks, which require separate management or priority for conservation. However, anthropogenic actions in the area of study, such as: the construction of dams, deforestation and the fishing exploitation, make the complex conservation and management measures. | eng |
| Resumo (português) dc.description.resumo | O grande bagre Pseudoplatystoma punctifer (surubim) está entre as cinco espécies de bagres da bacia Amazônica com maior valor comercial. Desempenha importante papel como predador de topo nos ecossistemas de água doce da Amazônia. O movimento das espécies aquáticas, nas bacias hidrográficas, pode ser interrompido por barreiras biogeográficas naturais formadas por comedeiras e cachoeiras que produzem biotas distintas. Existem diferenças claras entre as biotas (assembléias) de peixes da área que fica à montante e à jusante das cachoeiras do rio Madeira. As cachoeiras do rio Madeira delimitam duas regiões distintas: à montante, a sub-bacia dos rios Mamoré/Guaporé (que será chamada de sub-bacia do Mamoré/Guaporé) e à jusante, a sub-bacia do rio Madeira. O conhecimento de como o ciclo de vida de P. punctifer é influenciado pelas corredeiras e cachoeiras rio Madeira, levando em consideração a sua rota migratória e o quanto de variação genética ocorre nesta espécie, dentro e entre as sub-bacias, é muito importante para a conservação e para possíveis medidas de manejo. Foram realizadas análises moleculares através do sequenciamento do gene CO1 do DNA mitocondrial e de 10 !ocos microssatélites. O objetivo foi verificar se P. punctifer constitui uma população panmítica ou se existe algum tipo de segregação genética que possa ser relacionada com as cachoeiras do rio Madeira. Foram analisados 96 espécimes com o gene CO1 e 99 com os locos microssatélites, de seis localidades, sendo duas na sub-bacia do Mamoré/Guaporé e quatro na sub-bacia do rio Madeira, ambas na bacia Amazônica. Com o marcador CO1 foram observados 11 haplótipos, uma diversidade haplotípica de 0,600 e uma diversidade nucicotídica de 0,00157. Todos os !ocos microssatélites analisados foram altamente polimórficos, com o número de alclos por loco variando de dois (Ppu8) a 22 (Ppu4), em média 10,4 alclos por loco. O número total de alclos observados foi de 104, com 27 alclos exclusivos. Com base nos resultados da análise de variância molecular (AMOVA) c de fluxo gênico (Nm) observados entre das sub-bacias, para os microssatélites (FsT = 0,067; Nm= 6,883) e para o gene CO1 (0sT= 0,391; Nm= 0,643), não podemos rejeitar totalmente a hipótese de panmixia para Pseudoplatystoma punctifer. No entanto, foi evidenciada que os espécimes de P. punctifer das sub-bacias do rio Madeira e do Mamore/Guaporé apresentam uma diferenciação genética grande e intermediária para o gene CO1 e microssatélites, respectivamente. A diferenciação genética observada na análise baycsiana do programa BAPS, com os dados de CO1, mostrou claramente a existência de duas linhagens maternas, uma em cada sub-bacia. Este resultado pode estar relacionado com: o sedentarismo das fêmeas; as diferentes condições ambientais; o regime hídrico das sub-bacias do rio Madeira e do Mamoré/Guaporé e às corredeiras e cachoeiras do rio Madeira, que interrompem parcialmente o fluxo gênico. Propomos um modelo de migração dos machos, tendo como base os resultados da análise dos locos microssatélites e estudos prévios de ecologia. Nossos resultados indicaram a ocorrência de dois estoques pesqueiros, que precisam gestão separada ou prioridade para conservação. No entanto, as ações antropogênicas na área de estudo, tais como: a construção das hidrelétricas, o desmatamento e a exploração pesqueira, tomam as medidas de conservação e manejo complexas. | por |
| Agência de fomento / Financiador dc.description.sponsorship | FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas | por |
| Formato dc.format | application/pdf | * |
| Referência (citação) dc.identifier.citation | MACHADO, Antonio Saulo Cunha. Genética populacional do bagre amazônico Pseudoplatystoma punctifer (Siluriformes: Pimelodidae) nas sub-bacias dos rios Madeira e Mamoré/Guaporé. 2013. 77 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2013. | por |
| Endereço permanente (URI) dc.identifier.uri | http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6005 | |
| Idioma dc.language | por | por |
| Instituição / Editora dc.publisher | Universidade Federal do Amazonas | por |
| País dc.publisher.country | Brasil | por |
| Faculdade, Instituto ou Departamento dc.publisher.department | Instituto de Ciências Biológicas | por |
| Sigla da instituição dc.publisher.initials | UFAM | por |
| Programa de Pós-Graduação dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia | por |
| Tipo de acesso dc.rights | Acesso Aberto | por |
| Licença (endereço) dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| Área de conhecimento (CNPq) dc.subject.cnpq | CIÊNCIAS BIOLÓGICAS | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Peixes da Amazônia | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Surubim | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Genética de populações | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Marcadores microssatélites | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Estoque Pesqueiro | por |
| Miniatura (endereço) dc.thumbnail.url | http://tede.ufam.edu.br//retrieve/18947/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20-%20Antonio%20Saulo%20Cunha%20Machado.pdf.jpg | * |
| Título dc.title | Genética populacional do bagre amazônico Pseudoplatystoma punctifer (Siluriformes: Pimelodidae) nas sub-bacias dos rios Madeira e Mamoré/Guaporé | por |
| Tipo de documento dc.type | Dissertação | por |
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