Desenvolvimento de terapia genética multi alvo para tratamento do câncer cervical causado pelo HPV

dc.contributor.advisor-co1Astolfi Filho, Spartaco
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2699190136695057eng
dc.contributor.advisor-co1orcidhttps://orcid.org/0000-0001-7246-6350eng
dc.contributor.advisor1Oliveira, Cíntia Mara Costa de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8188087361251251eng
dc.contributor.advisor1orcidhttps://orcid.org/0000-0002-1065-8418eng
dc.contributor.referee1Brígido, Marcelo de Macedo
dc.contributor.referee2Ramasawmy, Rajendranath
dc.contributor.referee3Zulian, Juliana Pavan
dc.contributor.referee4Oliveira, Edilamar Menezes de
dc.creatorBarbosa Filho, Roberto Alexandre Alves
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4904715740574180eng
dc.creator.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-7555-8100eng
dc.date.issued2024-04-23
dc.description.abstractCervical cancer is the second most common cancer among women worldwide and the fourth leading cause of death among women in Brazil. Human papillomavirus (HPV) plays a central role in this disease, as its infection is considered a necessary condition for the development of more than 90% of cervical cancer cases. The standard treatment for the disease consists of radiotherapy with cisplatin-based chemotherapy and, since 2014, the SUS has made available the vaccines Gardasil (against HPVs 6, 11, 16, and 18) and Cervarix (against HPVs 16 and 18). However, the efficacy of these vaccines for the treatment of patients with cervical cancer is not clear. HPV-associated carcinogenesis provides a classic model for cancer therapies based on RNA gene silencing (RNAi), as its progression depends significantly on the viral oncogenes E6 and E7. Therefore, most RNAi-based therapeutic strategies developed to date use RNAi molecules targeting the E6 and/or E7 genes, achieving 50 to 80% silencing. The aim of this research is to propose a therapy for the treatment of cervical lesions caused by HPV 16 and HPV 18 based on siRNA and circRNA, designed with the aid of bioinformatics tools and tested in silico and in vitro. The in silico tests were performed with bioinformatics tools that analyzed thermodynamic stability, possible off-target effects, and similarity with already patented RNAi molecules. The in vitro tests, in turn, consisted of transfection of the synthesized siRNA and circRNA molecules into commercial cell lines HeLa (HPV 18 positive), Caski (HPV 16 positive), and C-33a (HPV negative cervical cancer), followed by qPCR and statistical analyses. For siRNA silencing, a tool was developed to select siRNA sequences based on physicochemical parameters, which also allowed verifying the viability of the chosen siRNAs. Similarity of the siRNAs with some targets already described in patents registered with the National Institute of Industrial Property (INPI) was observed. In vitro tests performed to date have shown that the therapy was able to significantly reduce the expression of the E6 and E7 genes in HeLa cells. However, additional tests with circRNA and Caski (HPV 16 positive) and C-33a (HPV negative cervical cancer) cell lines are still being performed to verify the viability of the therapy proposed by this work.eng
dc.description.resumoO câncer do colo do útero é a segunda causa de câncer mais comum entre as mulheres em todo o mundo e a quarta maior causa de morte entre as mulheres no Brasil. O papilomavírus humano (HPV) exerce um papel central nessa doença, pois sua infecção é considerada condição necessária para desenvolver mais de 90% dos casos de câncer de colo uterino. O tratamento padrão da doença consiste em radioterapia com quimioterapia à base de cisplatina e, desde 2014, o SUS disponibiliza as vacinas Gardasil (contra HPVs 6, 11, 16, e 18) e Cervarix (contra HPVs 16 e 18). No entanto, a eficácia dessas vacinas não é evidente para a terapia de pacientes com câncer cervical. A carcinogênese associada ao HPV fornece um modelo clássico para terapias de câncer baseadas em silenciamento gênico por RNA (RNAi), pois sua progressão depende significativamente dos oncogenes virais E6 e E7. Graças a isso, a maioria das estratégias de terapia baseadas em RNAi desenvolvidas até o momento utilizam moléculas de RNAi direcionadas contra os genes E6 e/ou E7, obtendo de 50 a 80% de silenciamento. O objetivo desta pesquisa é propor uma terapia para o tratamento de lesões cervicais causadas por HPV 16 e HPV 18 baseada em siRNA e circRNA, desenhados com auxílio de ferramentas de bioinformática e testados in silico e in vitro. Os testes in silico foram realizados com ferramentas de bioinformática que analisaram a estabilidade termodinâmica, possíveis efeitos off-target e a similaridade com moléculas de RNAi já patenteadas. Os testes in vitro, por sua vez, consistiram em transfecção das moléculas sintetizadas de siRNA e circRNA em linhagens celulares comerciais HeLa (HPV 18 positiva), Caski (HPV 16 positiva) e C-33a (câncer cervical HPV negativo), seguida de qPCR e análises estatísticas. Para o silenciamento por siRNA, foi desenvolvida uma ferramenta para seleção de sequências de siRNA baseada em parâmetros físico-químicos, que permitiu também verificar a viabilidade dos siRNAs escolhidos. Foi observada similaridade dos siRNAs com alguns alvos já descritos em patentes registradas no Instituto Nacional de Propriedade Industrial – INPI. Os testes in vitro realizados até o momento mostraram que a terapia conseguiu reduzir significativamente a expressão dos genes E6 e E7 em células HeLa. Todavia, testes adicionais com circRNA e linhagens celulares Caski (HPV 16 positiva) e C-33a (câncer cervical HPV negativo) ainda estão sendo realizados para verificar a viabilidade da terapia proposta por este trabalho.eng
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoeng
dc.description.sponsorshipFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa no Estado do Amazonaseng
dc.embargo.liftdatePeríodo de Embargo: 27/02/2025 - 16/06/2026por
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationBARBOSA FILHO, Roberto Alexandre Alves. Desenvolvimento de terapia genética multi alvo para tratamento do câncer cervical causado pelo HPV. 2024. 99 f. Tese (Doutorado em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus (AM), 2024.eng
dc.identifier.urihttps://tede.ufam.edu.br/handle/tede/10731
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentRede Bionorteeng
dc.publisher.initialsUFAMeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTEeng
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/pt_BR
dc.subjectCâncerpor
dc.subjectHPVpor
dc.subjectTerapiapor
dc.subjectRNAipor
dc.subject.cnpqOUTROSeng
dc.subject.otherCâncer em mulherespor
dc.subject.otherÚtero - Câncer - Formas de tratamentopor
dc.subject.otherPapilomavíruspor
dc.thumbnail.urlhttps://tede.ufam.edu.br/retrieve/82212/ITEM%20INDISPON%c3%8dVEL%20-%20Solicite%20c%c3%b3pia.pdf.jpg*
dc.thumbnail.urlhttps://tede.ufam.edu.br/retrieve/95269/TESE_RobertoBarbosaFilho_PPGBIONORTE.pdf.jpg*
dc.titleDesenvolvimento de terapia genética multi alvo para tratamento do câncer cervical causado pelo HPVeng
dc.typeTeseeng

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