Um método de estimação de expressões gênicas de câncer de mama com base em correlação
| Primeiro orientador dc.contributor.advisor1 | Nakamura, Fabíola Guerra | |
| Currículo Lattes do primeiro orientador dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9615041048900531 | eng |
| Primeiro membro da banca dc.contributor.referee1 | Sampaio, Vanderson de Souza | |
| Currículo Lattes do primeiro membro da banca dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/0039836167659650 | eng |
| Segundo membro da banca dc.contributor.referee2 | Colonna, Juan Gabriel | |
| Currículo Lattes do segundo membro da banca dc.contributor.referee2Lattes | http://lattes.cnpq.br/9535853909210803 | eng |
| Terceiro membro da banca dc.contributor.referee3 | Carvalho, André Luiz da Costa | |
| Currículo Lattes do terceiro membro da banca dc.contributor.referee3Lattes | http://lattes.cnpq.br/4863447798119856 | eng |
| Autor dc.creator | Rodrigues, Beatriz Albuquerque | |
| Currículo Lattes do autor dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/2392755488355808 | eng |
| ORCID do autor dc.creator.orcid | https://orcid.org/0009-0007-2712-0503 | eng |
| Data de defesa/publicação dc.date.issued | 2024-04-05 | |
| Resumo / Abstract dc.description.abstract | Gene expression data extracted through microarray technology often suffer from lost value issues due to problems such as dust or scratches on the slide. In breast cancer databases, the subsequent analysis and subtype classification can suffer greatly from missing data, so it is essential to address this problem. Several approaches to estimate these values in gene expression data have been developed, but the task is difficult due to factors such as the existence or not of a correlation structure in the data, the high dimensionality of the data (number of genes x number of samples), and the patterns and mechanisms of absence. In this research, we developed a method to estimate missing values in gene expressions of breast cancer, that deals with the high dimensionality of the data through the use of a set of genes that best characterize breast cancer and can contribute to a more accurate classification of subtypes. | por |
| Resumo (português) dc.description.resumo | Os dados de expressão de genes extraídas por meio da tecnologia de microarrays geralmente sofrem de problemas de valor perdido devido a problemas como poeira ou arranhões no slide. Em bases de dados de câncer de mama, a análise subsequente e a classificação de subtipos podem sofrer fortemente com a presença de dados omissos, sendo assim é primordial tratar esse problema. Várias abordagens para estimação desses valores em dados de expressão gênica foram desenvolvidas, mas a tarefa é difícil devido a fatores como a existência ou não de uma estrutura de correlação nos dados, à alta dimensionalidade dos dados (número de genes x número de amostras), e aos padrões e mecanismos de ausência. Nesta pesquisa, desenvolvemos um método, para estimar valores ausentes em expressões gênicas de cancêr de mama, que lida com a alta dimensinalidade dos dados por meio do uso de um conjunto de genes que melhor caracterizam o cancêr de mama e que podem contribuir para uma classificação mais precisa de subtipos. | eng |
| Agência de fomento / Financiador dc.description.sponsorship | FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas | eng |
| Formato dc.format | application/pdf | * |
| Referência (citação) dc.identifier.citation | RODRIGUES, Beatriz Albuquerque. Um método de estimação de expressões gênicas de câncer de mama com base em correlação. 2024. 90 f. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Federal do Amazonas, manaus (AM), 2024. | eng |
| Endereço permanente (URI) dc.identifier.uri | https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/11489 | |
| Idioma dc.language | por | eng |
| Instituição / Editora dc.publisher | Universidade Federal do Amazonas | eng |
| País dc.publisher.country | Brasil | eng |
| Faculdade, Instituto ou Departamento dc.publisher.department | Instituto de Computação | eng |
| Sigla da instituição dc.publisher.initials | UFAM | eng |
| Programa de Pós-Graduação dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Informática | eng |
| Tipo de acesso dc.rights | Acesso Aberto | |
| Licença (endereço) dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | por |
| Palavras-chave dc.subject | Expressões gênicas | por |
| Palavras-chave dc.subject | Valores Ausentes | por |
| Palavras-chave dc.subject | Estimação | por |
| Palavras-chave dc.subject | Câncer de Mama | por |
| Área de conhecimento (CNPq) dc.subject.cnpq | CIENCIAS EXATAS E DA TERRA: CIENCIA DA COMPUTACAO | eng |
| Termo controlado dc.subject.other | Neoplasias da Mama | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Biologia Computacional | por |
| Termo controlado dc.subject.other | Análise de Dados | por |
| Miniatura (endereço) dc.thumbnail.url | https://tede.ufam.edu.br/retrieve/91770/DISS_BeatrizRodrigues_PPGI.jpg | * |
| Título dc.title | Um método de estimação de expressões gênicas de câncer de mama com base em correlação | eng |
| Título alternativo dc.title.alternative | A correlation-based method for estimating breast cancer gene expressions | eng |
| Tipo de documento dc.type | Dissertação | eng |