Avaliação de variantes de base única (SNVs) em receptores da vitamina D (VDR) em pacientes com tuberculose
| dc.contributor.advisor-co1 | Ogusku, Mauricio Morishi | |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5288905856205986 | eng |
| dc.contributor.advisor1 | Sadahiro, Aya | |
| dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/8658798733544812 | eng |
| dc.contributor.advisor1orcid | https://orcid.org/0000-0002-3148-8163 | eng |
| dc.contributor.referee1 | Barcellos, José Fernando Marques | |
| dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9296854102700928 | eng |
| dc.contributor.referee1orcid | https://orcid.org/0000-0003-2149-7899 | eng |
| dc.contributor.referee2 | Garrido, Marlúcia da Silva | |
| dc.contributor.referee2Lattes | http://lattes.cnpq.br/7172382416203868 | eng |
| dc.contributor.referee3 | Ferreira, Karen Spadari | |
| dc.contributor.referee3Lattes | http://lattes.cnpq.br/9765455719275677 | eng |
| dc.contributor.referee3orcid | https://orcid.org/0000-0003-2832-5942 | eng |
| dc.contributor.referee4 | Ramasawmy, Rajendranath | |
| dc.contributor.referee4Lattes | http://lattes.cnpq.br/3420417277915974 | eng |
| dc.contributor.referee4orcid | https://orcid.org/0000-0002-0538-0773 | eng |
| dc.creator | Rocha, Laianne Lopes | |
| dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/4608479362089154 | eng |
| dc.date.issued | 2025-08-29 | |
| dc.description.abstract | Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis, remains one of the major global public health challenges, with high incidence rates particularly in regions such as Northern Brazil. In 2024, the state of Amazonas recorded the highest national incidence rate, with 94.7 cases per 100,000 inhabitants. Susceptibility to TB is influenced by social, environmental, and genetic factors, with vitamin D and its receptor (VDR) recognized as important modulators of the immune response to infection. This study aimed to investigate the association between single nucleotide variants (SNVs) in the VDR gene and the occurrence of pulmonary tuberculosis. A total of 640 individuals were included, comprising 321 patients and 319 controls, genotyped by qPCR for the SNVs rs2228570, rs7975232, rs731236, and rs1544410. The rs2228570 variant showed a significant association under the log-additive model (p = 0.046; OR = 1.26; 95% CI = 1.01–1.57), suggesting increased risk with higher frequency of the A allele. A significant protective effect was observed for rs731236 (dominant model: p = 0.012; OR = 0.67; 95% CI = 0.49–0.92) and rs1544410 (recessive model: p = 0.0002; OR = 0.33; 95% CI = 0.18–0.61), with the G and T alleles, respectively, associated with reduced disease risk. In contrast, the rs7975232 variant showed no significant association with TB in the tested models. Haplotype analysis revealed that the combination ACCA was significantly associated with increased TB risk (p = 0.0099), whereas the GATG haplotype was associated with a protective effect (p = 0.0151). Additionally, 25(OH)D quantification indicated hypovitaminosis D in a substantial proportion of individuals, with lower concentrations observed in TB patients. These findings reinforce the potential role of vitamin D and VDR gene variants in TB immunoregulation and contribute to the understanding of genetic susceptibility to the disease in a highly endemic population. Such evidence may guide future research on genetic biomarkers and modifiable risk factors in similar settings. | eng |
| dc.description.resumo | A tuberculose (TB), causada por Mycobacterium tuberculosis, permanece como um dos principais desafios da saúde pública global, com altas taxas de incidência especialmente em regiões como o Norte do Brasil. Em 2024, o estado do Amazonas liderou os índices nacionais, com 94,7 casos por 100 mil habitantes. A suscetibilidade à TB é influenciada por fatores sociais, ambientais e genéticos, sendo a vitamina D e seu receptor (VDR) reconhecidos como moduladores importantes da resposta imune frente à infecção. Este estudo teve como objetivo investigar a associação entre variantes de nucleotídeo único (SNVs) no gene VDR e a ocorrência de tuberculose pulmonar. Foram incluídos 640 indivíduos, sendo 321 pacientes e 319 controles, submetidos à genotipagem por qPCR para os SNVs rs2228570, rs7975232, rs731236 e rs1544410. A variante rs2228570 apresentou associação significativa no modelo log-aditivo (p=0,046; OR = 1,26; IC95% = 1,01–1,57), sugerindo aumento de risco com a presença crescente do alelo A. Observou-se efeito protetor estatisticamente significativo para as variantes rs731236 (modelo dominante: p = 0,012; OR = 0,67; IC95% = 0,49–0,92) e rs1544410 (modelo recessivo: p = 0,0002; OR = 0,33; IC95% = 0,18–0,61), cujos alelos G e T, respectivamente, estiveram associados a menor risco da doença. Em contraste, a variante rs7975232 não apresentou associação significativa com a TB nos modelos avaliados. A análise de haplótipos revelou que a combinação ACCA esteve significativamente associada ao risco aumentado de TB (p = 0,0099), enquanto o haplótipo GATG esteve associado a efeito protetor (p = 0,0151). Além disso, a dosagem de 25(OH)D indicou hipovitaminose D em parte expressiva dos indivíduos, com concentrações mais baixas observadas nos pacientes. Esses achados reforçam o papel potencial da vitamina D e das variantes do gene VDR na imunorregulação da TB, contribuindo para o entendimento da suscetibilidade genética à doença em uma população de alta carga endêmica. Tais evidências podem orientar futuras investigações sobre biomarcadores genéticos e fatores modificáveis de risco em contextos similares. | eng |
| dc.description.sponsorship | CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior | eng |
| dc.format | application/pdf | * |
| dc.identifier.citation | ROCHA, Laianne Lopes. Avaliação de variantes de base única (SNVs) em receptores da vitamina D (VDR) em pacientes com tuberculose. 2025. 118 f. Tese (Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2025. | eng |
| dc.identifier.uri | https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/11431 | |
| dc.language | por | eng |
| dc.publisher | Universidade Federal do Amazonas | eng |
| dc.publisher.country | Brasil | eng |
| dc.publisher.department | Instituto de Ciências Biológicas | eng |
| dc.publisher.initials | UFAM | eng |
| dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada | eng |
| dc.rights | Acesso Aberto | |
| dc.subject | Tuberculose | por |
| dc.subject | Vitamina D | por |
| dc.subject | Imunogenética | por |
| dc.subject | SNVs | por |
| dc.subject | VDR | por |
| dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS | eng |
| dc.subject.cnpq | CIENCIAS DA SAUDE | eng |
| dc.subject.other | Tuberculose pulmonar | por |
| dc.subject.other | Variação genética | por |
| dc.subject.other | Vitamina D | por |
| dc.subject.other | Receptores de calcitriol | por |
| dc.thumbnail.url | https://tede.ufam.edu.br/retrieve/91288/TESE_LaianneRocha_PPGIBA.pdf.jpg | * |
| dc.title | Avaliação de variantes de base única (SNVs) em receptores da vitamina D (VDR) em pacientes com tuberculose | eng |
| dc.title.alternative | Evaluation of single nucleotide variants (SNVs) in vitamin D receptors (VDR) in tuberculosis patients | eng |
| dc.type | Tese | eng |
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