Mineração genômica e caracterização química de compostos antifúngicos em uma nova espécie amazônica de Periconia sp

dc.contributor.advisor1Silva, Gilvan Ferreira da
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1000535673605322eng
dc.contributor.advisor1orcidhttps://orcid.org/0000-0003-2828-8299eng
dc.contributor.referee1Fernandes, Joelma dos Santos
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8884118027809527eng
dc.contributor.referee1orcidhttps://orcid.org/0009-0001-0263-6198eng
dc.contributor.referee2Barbosa, Larissa Kirsch
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/6547152812685055eng
dc.contributor.referee2orcidhttps://orcid.org/0000-0003-1580-2965eng
dc.creatorBandeira, Izabel Correa
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/2437066147679329eng
dc.creator.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-4411-1768eng
dc.date.issued2025-03-07
dc.description.abstractThe genus Periconia (Periconiaceae, Pleosporales) comprises a diversity of fungal species with significant ecological and biotechnological importance, notable for the production of bioactive secondary metabolites. This dissertation presents a comprehensive review of the genus and describes a new species, Periconia cyanoamazonica sp. nov. Analysis of databases such as MycoBank indicates the occurrence of 194 valid Periconia species, with only 30.4% having available molecular data, highlighting a significant gap in the genetic knowledge of the genus. When evaluating the different barcodes used for the genus phylogeny (ITS, LSU, SSU, and Tef1), nucleotide diversity analysis showed ITS as the most variable marker (π = 0.073787). The chemical review identified 158 compounds, predominantly terpenes (50%) and polyketides (38%), with various biological activities. Genomic analysis of five Periconia species revealed considerable variation in genome size (39-55 Mb) and number of genes (11,027-18,854). P. cyanoamazonica was isolated in the Molecular Biology laboratory of Embrapa Western Amazon as a contaminant in culture plates during the study of endophytic fungi associated with Picrolemma sprucei. P. cyanoamazonica was characterized by a polyphasic approach, including multilocus phylogenetic, morphological, and chemical analyses. Genome analysis revealed 76 biosynthetic gene clusters (BGCs), with 80% showing no similarity to known BGCs. Two clusters of particular interest were identified: one potentially responsible for the production of the blue-greenish pigment and another possibly involved in the biosynthesis of Peritoxin A or an analog. P. cyanoamazonica demonstrated significant antifungal activity against various phytopathogenic fungi of agricultural interest, with inhibition of up to 98.52% against Rhizoctonia solani, and larvicidal activity against Aedes aegypti, reaching 100% mortality in 72 hours at 500 µg/mL. HPLC-MS/MS analysis identified a major compound (m/z 575 [M+H]) with a profile consistent with Peritoxin A. This study not only expands the taxonomic, genomic, and chemical knowledge of the genus Periconia but also establishes P. cyanoamazonica as a new species with significant biotechnological potential, highlighting the importance of exploring fungal biodiversity regardless of its origin.eng
dc.description.resumoO gênero Periconia (Periconiaceae, Pleosporales) compreende uma diversidade de espécies fúngicas com significativa importância ecológica e biotecnológica, destacando-se pela produção de metabólitos secundários bioativos. Esta dissertação apresenta uma revisão abrangente do gênero e descreve uma nova espécie, Periconia cyanoamazonica. A análise em bancos de dados como MycoBank indicam a ocorrência de 194 espécies válidas de Periconia, com apenas 30,4% possuindo dados moleculares disponíveis, destacando uma lacuna significativa no conhecimento genético do gênero. Quando avaliados os diferentes barcodes utilizados para a filogenia do gênero (ITS, LSU, SSU e Tef1) a análise de diversidade nucleotídica mostrou o ITS como o marcador mais variável (π = 0,073787). A revisão química identificou 158 compostos, predominantemente terpenos (50%) e policetídeos (38%), com diversas atividades biológicas. A análise genômica de cinco espécies de Periconia revelou uma variação considerável no tamanho do genoma (39 55 Mb) e no número de genes (11.027-18.854). Periconia cyanoamazonica sp. nov., foi isolada no laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Amazônia Ocidental, como um contaminante em placas de cultura, durante o estudo de fungos endofíticos associados a Picrolemma sprucei. P. cyanoamazonica foi caracterizada por uma abordagem polifásica, incluindo análises filogenéticas multilocus, morfológicas e químicas. A análise de genoma revelou 76 biosynthetic gene clusters (BGCs), sendo 80% sem alguma similaridade com BGCs conhecidos. Dois clusters de particular interesse foram identificados: um potencialmente responsável pela produção do pigmento azul-esverdeado e outro possivelmente envolvido na biossíntese de Peritoxin A ou análogo. P. cyanoamazonica demonstrou significativa atividade antifúngica contra diversos fungos fitopatogênicos de interesse agrícola, com inibição de até 98,52% contra Rhizoctonia solani, e atividade larvicida contra Aedes aegypti, atingindo 100% de mortalidade em 72 horas a 500 µg/mL. A análise por HPLC-MS/MS identificou um composto majoritário (m/z 575 [M+H]) com perfil consistente com Peritoxin A. Este estudo não apenas amplia o conhecimento taxonômico, genômico e químico do gênero Periconia, mas também estabelece P. cyanoamazonica como uma nova espécie com potencial biotecnológico significativo, destacando a importância da exploração da biodiversidade fúngica independente de sua origem.eng
dc.description.sponsorshipFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonaseng
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationBANDEIRA, Izabel Correa. Mineração genômica e caracterização química de compostos antifúngicos em uma nova espécie amazônica de Periconia sp. 2025. 124 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2025.eng
dc.identifier.urihttps://tede.ufam.edu.br/handle/tede/11432
dc.languageporeng
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaseng
dc.publisher.countryBrasileng
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicaseng
dc.publisher.initialsUFAMeng
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologiaeng
dc.rightsAcesso Embargado
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectPericoniapor
dc.subjectTaxonomiapor
dc.subjectPigmentospor
dc.subjectPeritoxin Apor
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS: GENETICA: GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSeng
dc.subject.otherTaxonomiapor
dc.subject.otherFungospor
dc.subject.otherPingmentospor
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dc.titleMineração genômica e caracterização química de compostos antifúngicos em uma nova espécie amazônica de Periconia speng
dc.title.alternativeGenomic mining and chemical characterization of antifungal compounds in a new Amazonian Periconia species.eng
dc.typeDissertaçãoeng

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